Teritoriul comunei Bălușeni face parte din județul Botoșani, fiind printre primele 15 comune ale județului după numărul de locuitori și între primele 25 ca suprafață teritorială, situată în partea central-sudică a județului, limitrofă cu: municipiul Botoșani - reședința de județ, în partea sud-estică a acestuia; comuna Stăuceni, la nord; comunele Sulița și Blândești, la est; comunele Copălău și Cristești, la sud; comuna Curtești, la vest.